Kui palju on Omicroni toksilisus vähenenud? Mitmed reaalse maailma uuringud näitavad

"Omicroni virulentsus on lähedane hooajalise gripi omale" ja "Omicron on oluliselt vähem patogeenne kui Delta". …… Viimasel ajal on Internetis levinud palju uudiseid uue kroonmutantse tüve Omicron virulentsuse kohta.

Tõepoolest, alates Omicroni mutantsetüve esilekerkimisest 2021. aasta novembris ja selle ülemaailmsest levimusest on virulentsuse ja edasikandumise teemalised uuringud ja arutelud jätkunud. Milline on Omicroni praegune virulentsuse profiil? Mida uuringud selle kohta ütlevad?

Erinevad laboriuuringud: Omicron on vähem virulentne
Tegelikult leiti juba 2022. aasta jaanuaris Hongkongi ülikooli Li Ka Shingi arstiteaduskonna uuringus, et Omicron (B.1.1.529) võib olla algse tüvega ja teiste mutantsete tüvedega võrreldes vähem patogeenne.
Leiti, et Omicroni mutantne tüvi oli transmembraanse seriinproteaasi (TMPRSS2) kasutamisel ebaefektiivne, samas kui TMPRSS2 võib hõlbustada viiruse invasiooni peremeesrakkudesse, lõhustades uue koroonaviiruse piigivalgu. Samal ajal täheldasid teadlased, et Omicroni replikatsioon vähenes oluliselt inimese rakuliinides Calu3 ja Caco2.

Pildiallikas Internet

K18-hACE2 hiiremudelis vähenes Omicroni replikatsioon nii hiirte ülemistes kui alumistes hingamisteedes võrreldes algse tüvega ja Delta mutandiga ning selle kopsupatoloogia oli vähem tõsine, samas kui Omicroni infektsioon põhjustas vähem kaalulangust ja suremust kui algne tüvi ja alfa-, beeta- ja deltamutandid.
Seetõttu jõudsid teadlased järeldusele, et Omicroni replikatsioon ja patogeensus olid hiirtel vähenenud.

Pildiallikas Internet

16. mail 2022 avaldas Nature Tokyo ülikooli ja Wisconsini ülikooli juhtiva viroloogi Yoshihiro Kawaoka artikli, milles kinnitati esimest korda loommudelis, et Omicron BA.2 on tõepoolest vähem virulentne kui eelmine algne tüvi.

Teadlased valisid k18-hACE2 hiirte ja hamstrite nakatamiseks välja Jaapanis isoleeritud elusad BA.2 viirused ning leidsid, et pärast sama viiruseannusega nakatumist olid nii BA.2 kui ka BA.1 nakatunud hiirtel viiruse tiitrid kopsudes ja ninas oluliselt madalamad kui algsel New Crown tüve infektsioonil (p < 0,0001).

See kuldstandardi tulemus kinnitab, et Omicron on tõepoolest vähem virulentne kui algne metsiktüüp. Seevastu loommudelitel pärast BA.2 ja BA.1 infektsiooni viiruse tiitrites kopsudes ja ninas olulist erinevust ei täheldatud.

Pildiallikas Internet

PCR viiruskoormuse analüüsid näitasid, et nii BA.2 kui ka BA.1 nakatunud hiirtel oli kopsudes ja ninas madalam viiruskoormus kui algsel New Crown tüvel, eriti kopsudes (p<0,0001).

Sarnaselt hiirte tulemustele olid BA.2 ja BA.1 nakatunud hamstrite ninas ja kopsudes tuvastatud viiruse tiitrid pärast sama viiruseannusega inokuleerimist madalamad kui algsel tüvel, eriti kopsudes, ja veidi madalamad BA.2-ga nakatunud hamstrite ninas, kui BA.2 nakatunud hamstrite puhul BA.2. ei arene kopsupõletikku.

Lisaks leiti, et algsetel tüvedel BA.2 ja BA.1 puudus seerumite ristneutraliseerimine pärast nakatumist – see on kooskõlas sellega, mida on täheldatud reaalsete inimeste puhul, kui nad olid nakatunud erinevate uute kroonimutantidega.

Pildiallikas Internet

Reaalmaailma andmed: Omicron põhjustab väiksema tõenäosusega tõsiseid haigusi

Mitmed ülaltoodud uuringud on kirjeldanud Omicroni vähenenud virulentsust laboriloomade mudelites, kuid kas see kehtib ka reaalses maailmas?

7. juunil 2022 avaldas WHO aruande, milles hinnati Omicroni (B.1.1.529) epideemia ajal nakatunud inimeste raskusastet võrreldes Delta pandeemiaga.

Aruanne hõlmas 16 749 uut koronaarhaiget kõigist Lõuna-Aafrika provintsidest, sealhulgas 16 749 Delta epideemia (2021/8/2021 kuni 2021/10/3) ja 17 693 Omicroni epideemia (2021/11/15 kuni 2022/2/16). Patsiendid liigitati ka rasketeks, tõsisteks ja mittetõsisteks.

kriitiline: on saanud invasiivset ventilatsiooni või hapnikku ja suure vooluhulgaga transnasaalset hapnikku või kehavälist membraani hapnikuga varustamist (ECMO) või haiglaravi ajal intensiivraviosakonda.
-raske (raske): sai haiglaravi ajal hapnikku
-mitteraske: kui ükski ülaltoodud tingimustest ei ole täidetud, on patsient mitteraske.

Andmed näitasid, et Delta rühmas olid 49,2% tõsised, 7,7% kriitilised ja 28% kõigist hospitaliseeritud Delta-nakkusega patsientidest suri, samas kui Omicroni rühmas oli 28,1% tõsiseid, 3,7% kriitilisi ja 15% kõigist haiglaravil olnud Omicroniga nakatunud patsientidest suri. Samuti oli Delta rühmas viibimise keskmine kestus 7 päeva, Omicroni rühmas aga 6 päeva.

Lisaks analüüsiti aruandes vanuse, soo, vaktsineerimise staatuse ja kaasuvate haiguste mõjutegureid ning jõuti järeldusele, et Omicron (B.1.1.529) oli seotud väiksema tõenäosusega haigestuda tõsisesse ja kriitilisse haigusesse (95% CI: 0,41 kuni 0,46; p < 0,001) ja väiksema riskiga surra haiglas (905% CI: 95% kuni 95% haigestumisest). 0,65; p<0,001).

Pildiallikas Internet

Omicroni erinevate alatüüpide puhul on edasised uuringud üksikasjalikult analüüsinud ka nende virulentsust.

Uus-Inglismaa kohortuuringus analüüsiti 20770 Delta, 52605 Omicron B.1.1.529 ja 29840 Omicron BA.2 juhtumit ning leiti, et surmade osakaal oli Delta puhul 0,7%, B.1.1.529 puhul 0,4% ja BA 0,2%. Pärast segavate teguritega kohandamist jõuti uuringus järeldusele, et BA.2 puhul oli surmarisk oluliselt väiksem kui Delta ja B.1.1.529 puhul.

Pildiallikas Internet

Teises Lõuna-Aafrika uuringus hinnati Delta, BA.1, BA.2 ja BA.4/BA.5 puhul haiglaravi riski ja raskete tagajärgede riski. Tulemused näitasid, et analüüsi kaasatud 98 710 äsja nakatunud patsiendist viidi haiglasse 3825 (3,9%), kellest 1276 (33,4%) haigestus raskesti.

Erinevate mutatsioonidega nakatunute hulgas tekkis raske haigus 57,7% Delta-nakkusega patsientidest (97/168), võrreldes 33,7% BA.1-ga nakatunud patsientidega (990/2940), 26,2% BA.2-ga (167/637) ja 27,5% BA.2//BA05-ga (). Mitme muutujaga analüüs näitas, et tõenäosus haigestuda raskesse haigusse nakatunute seas Delta > BA.1 > BA.2, samas kui tõenäosus haigestuda raskesse haigusse nakatunute seas BA.4/BA.5 ei erinenud oluliselt võrreldes BA.2-ga.
Vähenenud virulentsus, kuid valvsus on vajalik

Laboratoorsed uuringud ja reaalsed andmed mitmest riigist on näidanud, et Omicron ja selle alatüübid on vähem virulentsed ja vähem tõenäoline, et nad põhjustavad tõsiseid haigusi kui algne tüvi ja teised mutantsed tüved.

Ajakirja The Lancet 2022. aasta jaanuarinumbri ülevaateartikkel pealkirjaga "Milder but not mild" märkis aga, et kuigi Omicroni infektsioon moodustas Lõuna-Aafrika noorema elanikkonna hulgas 21% haiglaravi juhtudest, suureneb tõenäoliselt rasket haigust põhjustavate haiguspuhangute osakaal erineva nakkustaseme ja erineva vaktsineerimistasemega populatsioonides. (Sellest hoolimata oli selles üldiselt noores Lõuna-Aafrika populatsioonis 21% SARS-CoV-2 omikronivariandiga nakatunud hospitaliseeritud patsientidest raske kliiniline tulemus – see osakaal võib suureneda ja avaldada haiguspuhangute ajal olulist mõju erineva demograafilise iseloomuga populatsioonides ja madalama infektsioonist või vaktsiinist tuleneva immuunsusega populatsioonides.)

Eespool mainitud WHO aruande lõpus märkis töörühm, et vaatamata eelmise tüve vähenenud virulentsusele tekkis peaaegu kolmandikul haiglaravil Omicroni (B.1.1.529) patsientidest raske haigus ning mitmesugused uued kroonimutandid põhjustasid jätkuvalt kõrget haigestumust ja suremust eakatel, immuunpuudulikkusega või vaktsineerimata elanikkonnal. (Samuti tahaksime hoiatada, et meie analüüsi ei tohiks pidada "kerge" variandi narratiivi toetavaks. Peaaegu kolmandikul haiglaravil viibinud Omicroni patsientidest tekkis tõsine haigus ja 15% suri; arvud, mis ei ole tähtsusetud……Haavatavate elanikkonnarühmade hulgas, st äärmuslikus vanuses patsiendid, populatsioonides, kus on kõrge kaasuvate haigustega haiged, haiged, Lenduvad orgaanilised ühendid) aitavad jätkuvalt kaasa olulisele haigestumusele ja suremusele.)

Omicroni varasemad andmed Hongkongi pandeemia viienda laine vallandamisel näitasid, et 4. mai 2022 seisuga suri viienda laine ajal 1192765 äsja kroonitud juhtumist 9115 surmajuhtumit (tooresuremuskordaja 0,76%) ja toorsuremus 2,70-aastastel üle 60-aastastel. 19,30% sellest vanuserühmast olid vaktsineerimata).

Seevastu ainult 2% üle 60-aastastest uusmeremaalastest on vaktsineerimata, mis on tugevas korrelatsioonis uue krooniepideemia madala toorsuremuse määraga 0,07%.

Teisest küljest, kuigi sageli väidetakse, et Newcastle võib tulevikus muutuda hooajaliseks endeemiliseks haiguseks, on akadeemilisi eksperte, kes on teistsugusel seisukohal.

Kolm teadlast Oxfordi ülikoolist ja Euroopa Liidu Teadusuuringute Ühiskeskusest usuvad, et Omicroni väiksem raskusaste võib olla lihtsalt juhus ning jätkuv kiire antigeenne evolutsioon (antigeenne evolutsioon) võib tuua kaasa uusi variante.

Erinevalt immuunsest põgenemisest ja edasikanduvusest, mis alluvad tugevale evolutsioonilisele survele, on virulentsus tavaliselt vaid evolutsiooni „kõrvalsaadus”. Viirused arenevad selleks, et maksimeerida nende levimisvõimet ja see võib samuti kaasa tuua virulentsuse suurenemise. Näiteks suurendades viiruskoormust, et hõlbustada levikut, võib see siiski põhjustada raskemaid haigusi.

Vähe sellest, virulentsus põhjustab viiruse leviku ajal ka väga piiratud kahju, kui viiruse põhjustatud sümptomid ilmnevad peamiselt hiljem nakatumise ajal – näiteks gripiviiruste, HIV ja C-hepatiidi viiruste puhul, kui nimetada vaid mõnda, millel on enne tõsiste tagajärgede tekitamist palju aega levida.

Pildiallikas Internet

Sellistes tingimustes võib Omicroni madalama virulentsusega uue kroonmutantsetüve suundumust olla raske ennustada, kuid hea uudis on see, et uus kroonvaktsiin on näidanud kõigi mutantsete tüvede puhul vähendatud raskete haiguste ja surma riski ning elanikkonna agressiivselt suurendav vaktsineerimismäär on endiselt oluline viis epideemiaga võitlemisel selles etapis.
Tänuavaldused: selle artikli on professionaalselt läbi vaadanud Panpan Zhou, PhD, Tsinghua ülikooli meditsiinikooli ja järeldoktor, Scrippsi uurimisinstituut, USA
Omicroni isetestitav antigeeni reaktiiv kodus