Kui palju on Omicroni toksilisus vähenenud? Mitmed reaalmaailma uuringud näitavad

„Omikroni virulentsus on lähedane hooajalise gripi omale“ ja „Omikron on oluliselt vähem patogeenne kui Delta“. …… Hiljuti on internetis levinud palju uudiseid uue kroonmutantsetüve Omikroni virulentsuse kohta.

Tõepoolest, alates Omicroni mutantse tüve ilmumisest 2021. aasta novembris ja selle ülemaailmsest levikust on virulentsuse ja leviku uurimine ja arutelud jätkunud väsimatult. Milline on Omicroni praegune virulentsusprofiil? Mida uuringud selle kohta ütlevad?

Erinevad laboriuuringud: Omicron on vähem virulentne
Tegelikult leidis juba 2022. aasta jaanuaris Hongkongi Ülikooli Li Ka Shingi meditsiiniteaduskonna uuring, et Omicron (B.1.1.529) võib olla vähem patogeenne võrreldes algse tüve ja teiste mutantsete tüvedega.
Leiti, et Omicroni mutanttüvi ei kasutanud transmembraanset seriinproteaasi (TMPRSS2) tõhusalt, samas kui TMPRSS2 võis uue koroonaviiruse ogavalgu lõhustamise teel hõlbustada viiruse invasiooni peremeesrakkudesse. Samal ajal täheldasid teadlased, et Omicroni replikatsioon oli inimese rakuliinides Calu3 ja Caco2 oluliselt vähenenud.
Uus koroonaviiruse tüvi on nõrgenenud

Pildi allikas internet

k18-hACE2 hiiremudelis oli omikroni replikatsioon hiirtel nii ülemistes kui ka alumistes hingamisteedes vähenenud võrreldes algse tüve ja Delta mutandiga ning selle kopsupatoloogia oli vähem raske, samas kui omikroni infektsioon põhjustas vähem kaalulangust ja suremust kui algne tüvi ning Alpha, Beta ja Delta mutandid.
Seetõttu jõudsid teadlased järeldusele, et hiirtel oli omikroni replikatsioon ja patogeensus vähenenud.
A8

Pildi allikas internet

16. mail 2022 avaldas ajakiri Nature Tokyo ülikooli ja Wisconsini ülikooli juhtiva viroloogi Yoshihiro Kawaoka artikli, milles kinnitati loommudelil esmakordselt, et Omicron BA.2 on tõepoolest vähem virulentne kui eelmine algne tüvi.

Teadlased valisid Jaapanis isoleeritud elusaid BA.2 viiruseid, et nakatada k18-hACE2 hiiri ja hamstreid, ning leidsid, et pärast sama viirusedoosiga nakatamist olid nii BA.2 kui ka BA.1 nakatunud hiirtel kopsudes ja ninas oluliselt madalamad viiruse tiitrid kui algse New Crown tüve infektsiooni korral (p<0,0001).

See kuldstandardi tulemus kinnitab, et Omicron on tõepoolest vähem virulentne kui algne metsiktüüp. Seevastu ei täheldatud BA.2 ja BA.1 infektsioonide järgselt loommudelite kopsudes ja ninades viirustiitrites olulist erinevust.
Viiruse PCR-i tuvastamise andmed

Pildi allikas internet

PCR-viiruskoormuse testid näitasid, et nii BA.2 kui ka BA.1-ga nakatunud hiirtel oli kopsudes ja ninas madalam viiruskoormus kui algsel New Crowni tüvel, eriti kopsudes (p<0,0001).

Sarnaselt hiirtel saadud tulemustega olid BA.2 ja BA.1 nakatunud hamstrite ninas ja kopsudes tuvastatud viirustiitrid pärast sama viirusedoosiga „inokuleerimist“ madalamad kui algsel tüvel, eriti kopsudes, ja BA.2 nakatunud hamstrite ninas veidi madalamad kui BA.1 – tegelikult ei arenenud pooltel BA.2 nakatunud hamstritest kopsuinfektsiooni.

Lisaks leiti, et algsetel tüvedel BA.2 ja BA.1 puudus seerumite ristneutralisatsioon pärast nakatumist – see on kooskõlas sellega, mida on täheldatud reaalsetes inimestes, kui neid on nakatunud erinevate uute kroonmutantidega.
Hamstri seerum

Pildi allikas internet

Reaalsed andmed: Omikron põhjustab väiksema tõenäosusega tõsiseid haigusi

Mitmed ülaltoodud uuringud on kirjeldanud Omicroni vähenenud virulentsust laboriloomade mudelites, aga kas sama kehtib ka reaalses maailmas?

7. juunil 2022 avaldas WHO aruande, milles hinnati nakatumise raskusastme erinevust Omikroni (B.1.1.529) epideemia ja Delta pandeemia ajal.

Aruandes oli kirjas 16 749 uut koronaararterite tõttu statsionaarselt ravi saavat patsienti Lõuna-Aafrika Vabariigi kõikidest provintsidest, sealhulgas 16 749 Delta epideemia ajal (2.08.2021–3.10.2021) ja 17 693 Omikroni epideemia ajal (15.11.2021–16.02.2022). Patsiendid liigitati ka rasketeks, tõsisteks ja mittetõsisteks.

kriitiline: pärast invasiivset ventilatsiooni või hapniku ja suure vooluhulgaga transnasaalse hapniku manustamist või kehavälise membraan-oksügenatsiooni (ECMO) saamist või haiglaravi ajal intensiivraviosakonda vastuvõtmist.
-raske (raske): sai haiglaravi ajal hapnikku
-mitteraske: kui ükski ülaltoodud tingimustest ei ole täidetud, ei ole patsiendi seisund raske.

Andmed näitasid, et Delta rühmas oli 49,2% tõsine, 7,7% kriitiline ja 28% kõigist hospitaliseeritud Delta-nakkusega patsientidest suri, samas kui Omicroni rühmas oli 28,1% tõsine, 3,7% kriitiline ja 15% kõigist hospitaliseeritud Omicroni-nakkusega patsientidest suri. Samuti oli Delta rühmas haiglas viibimise mediaanpikkus 7 päeva võrreldes Omicroni rühma 6 päevaga.

Lisaks analüüsis aruanne mõjutegureid nagu vanus, sugu, vaktsineerimisstaatus ja kaasuvad haigused ning jõudis järeldusele, et Omicron (B.1.1.529) oli seotud raske ja kriitilise haigestumise väiksema tõenäosusega (95% CI: 0,41–0,46; p<0,001) ja haiglas surma väiksema riskiga (95% CI: 0,59–0,65; p<0,001).
Kohorti ellujäämine variandi tüübi ja raskusastme järgi haiglas viibimise 28. päevani

Pildi allikas internet

Omikroni erinevate alatüüpide puhul on edasistes uuringutes üksikasjalikult analüüsitud ka nende virulentsust.

Uus-Inglismaal läbi viidud kohortuuringus analüüsiti 20 770 Delta, 52 605 Omicron B.1.1.529 ja 29 840 Omicron BA.2 juhtu ning leiti, et surmajuhtumite osakaal oli Delta puhul 0,7%, B.1.1.529 puhul 0,4% ja BA.2 puhul 0,3%. Pärast segavate tegurite arvessevõtmist jõuti uuringus järeldusele, et surmarisk oli BA.2 puhul oluliselt madalam võrreldes nii Delta kui ka B.1.1.529-ga.
Delta ja Omikroni variandi COVID-19 juhtumite korrigeerimata tulemused

Pildi allikas internet

Teises Lõuna-Aafrika Vabariigis läbi viidud uuringus hinnati haiglaravi riski ja raske tulemuse riski Delta, BA.1, BA.2 ja BA.4/BA.5 puhul. Tulemused näitasid, et analüüsi kaasatud 98 710 äsja nakatunud patsiendist hospitaliseeriti 3825 (3,9%), kellest 1276-l (33,4%) tekkis raske haigus.

Erinevate mutatsioonidega nakatunute seas tekkis 57,7%-l Delta-infektsiooniga patsientidest raske haigus (97/168), võrreldes 33,7%-ga BA.1-infektsiooniga patsientidest (990/2940), 26,2%-ga BA.2-infektsiooniga patsientidest (167/637) ja 27,5%-ga BA.4/BA.5-infektsiooniga patsientidest (22/80). Mitmemõõtmeline analüüs näitas, et tõsise haiguse tekkimise tõenäosus Delta > BA.1 > BA.2 nakatunute seas, samas kui BA.4/BA.5 nakatunute seas ei erinenud tõsise haiguse tekkimise tõenäosus BA.2-ga võrreldes oluliselt.
Vähenenud virulentsus, kuid valvsus on vajalik

Laboratoorsed uuringud ja mitme riigi tegelikud andmed on näidanud, et Omicron ja selle alatüübid on vähem virulentsed ja põhjustavad väiksema tõenäosusega tõsiseid haigusi kui algne tüvi ja teised mutantsed tüved.

Kuid ajakirja The Lancet 2022. aasta jaanuari numbris avaldatud ülevaateartiklis pealkirjaga „Kergem, aga mitte kerge“ märgiti, et kuigi omikroni infektsioon moodustas 21% Lõuna-Aafrika noorema elanikkonna haiglaravi juhtudest, suurenes rasket haigust põhjustavate puhangute osakaal tõenäoliselt erineva nakatumistaseme ja vaktsineerimistasemega populatsioonides. (Sellest hoolimata oli selles üldiselt noores Lõuna-Aafrika populatsioonis 21%-l SARS-CoV-2 omikroni variandiga nakatunud haiglaravil olevatest patsientidest raske kliiniline tulemus, mis võib puhangute ajal suureneda ja avaldada olulist mõju erinevate demograafiliste näitajate ja madalama nakkusest või vaktsiinist tuleneva immuunsuse tasemega populatsioonides.)

Eelmainitud WHO aruande lõpus märkis töörühm, et vaatamata eelmise tüve vähenenud virulentsuse tasemele tekkis ligi kolmandikul hospitaliseeritud Omicroni (B.1.1.529) patsientidest raske haigus ning et mitmesugused uued kroonmutandid põhjustasid jätkuvalt kõrget haigestumust ja suremust eakatel, immuunpuudulikkusega või vaktsineerimata populatsioonidel. (Samuti soovime hoiatada, et meie analüüsi ei tohiks vaadelda kui „kerge“ variandi narratiivi toetavat tegurit. Ligi kolmandikul hospitaliseeritud Omicroni patsientidest tekkis raske haigus ja 15% suri; arvud, mis ei ole tähtsusetud... Haavatavate populatsioonide, st äärmuslikus vanuses patsientide, suure kaasuvate haiguste koormusega populatsioonide, nõrkade patsientide ja vaktsineerimata seas aitab COVID-19 (kõik lenduvad orgaanilised ühendid) jätkuvalt kaasa olulisele haigestumusele ja suremuse tekkele.)

Omicroni varasemad andmed Hongkongis pandeemia viienda laine vallandusest näitasid, et 4. mai 2022 seisuga oli viienda laine ajal 1 192 765 äsja diagnoositud inimesest 9115 surmajuhtumit (toores suremus 0,76%) ja üle 60-aastaste inimeste toores suremus 2,70% (umbes 19,30% sellest vanuserühmast olid vaktsineerimata).

Seevastu on vaid 2% üle 60-aastastest Uus-Meremaa elanikest vaktsineerimata, mis on tugevas korrelatsioonis uue koroonaepideemia madala toore suremuse määraga, mis on 0,07%.

Teisest küljest, kuigi sageli väidetakse, et Newcastle'ist võib tulevikus saada hooajaline, endeemiline haigus, on akadeemilisi eksperte, kes on teisel seisukohal.

Kolm Oxfordi Ülikooli ja Euroopa Liidu Teadusuuringute Ühiskeskuse teadlast usuvad, et Omikroni madalam raskusaste võib olla lihtsalt kokkusattumus ning et jätkuv kiire antigeenne evolutsioon võib kaasa tuua uusi variante.

Erinevalt immuunsüsteemist pääsemisest ja edasikanduvuses levimisest, mis on tugeva evolutsioonilise surve all, on virulentsus tavaliselt vaid evolutsiooni „kõrvalprodukt“. Viirused arenevad, et maksimeerida oma levikuvõimet, ja see võib samuti viia virulentsuse suurenemiseni. Näiteks viiruskoormuse suurendamine edasikandumise hõlbustamiseks võib ikkagi põhjustada raskema haiguse.

Lisaks sellele tekitab virulentsus viiruse leviku ajal väga piiratud kahju, kui viiruse põhjustatud sümptomid ilmnevad peamiselt hilisemas nakkuse staadiumis – näiteks gripiviiruste, HIV ja C-hepatiidi viiruste puhul, millel on enne tõsiste tagajärgede tekkimist piisavalt aega levida.
SARS-CoV-2 mõju inimpopulatsioonidele

Pildi allikas internet

Sellistes oludes võib olla keeruline ennustada uue kroonmutanttüve suundumust Omicroni madalama virulentsuse põhjal, kuid hea uudis on see, et uus kroonvaktsiin on näidanud kõigi mutanttüvede vastu vähenenud raske haigestumise ja surma riski ning populatsiooni vaktsineerimise määra agressiivne suurendamine on selles etapis endiselt oluline viis epideemia vastu võitlemiseks.
Tänusõnad: Selle artikli on professionaalselt läbi vaadanud Panpan Zhou, PhD, Tsinghua ülikooli meditsiinikoolist ja järeldoktor, Scrippsi uurimisinstituut, USA.
Omicroni kodus kasutatav enesetestimise antigeeni reagent


Postituse aeg: 08. detsember 2022
Privaatsusseaded
Küpsiste nõusoleku haldamine
Parima kogemuse pakkumiseks kasutame seadmeteabe salvestamiseks ja/või sellele juurdepääsuks selliseid tehnoloogiaid nagu küpsised. Nende tehnoloogiatega nõustumine võimaldab meil töödelda sellel saidil andmeid, näiteks sirvimiskäitumise või unikaalsete ID-de kohta. Nõusoleku andmata jätmine või tagasivõtmine võib teatud funktsioone ja funktsioone negatiivselt mõjutada.
✔ Vastuvõetud
✔ Nõustu
Keeldu ja sulge
X