Uudised - Uus võrdlusalus keskkonnavee DNA ekstraheerimiseks — Bigefei sekveneerimine kiirendab teadusuuringuid

Magnethelme meetod lahendab tõhusalt keskkonnavee DNA ekstraheerimise väljakutsed

Sellistes valdkondades nagu keskkonnamikrobioloogia uuringud ja veereostuse seire on kvaliteetse genoomse DNA ekstraheerimine kriitilise tähtsusega eeltingimus järgnevate rakenduste, sealhulgas PCR/qPCR ja järgmise põlvkonna sekveneerimise (NGS) jaoks. Keskkonnaveeproovid on aga väga keerulised, sisaldades mitmekesiseid mikroobikooslusi, raskesti lüüsitavaid tüvesid, näiteks grampositiivseid baktereid, ja traditsiooniliste ekstraheerimismeetoditega seotud pikaajalisi väljakutseid – näiteks toksiliste reagentide ja keeruliste protseduuride kasutamist –, mis on teadlasi pidevalt vaevanud.

Nüüd tutvustab Bigfish Sequencing BFMP24R magnethelmestel põhinevat keskkonnavee genoomse DNA ekstraheerimise ja puhastamise komplekti, mis pakub uuendusliku tehnoloogia ja kasutajasõbraliku disaini abil neile väljakutsetele tervikliku lahenduse.

Toote ülevaade

See komplekt põhineb optimeeritud puhversüsteemil, mis on kombineeritud kõrgjõudlusega nanomagnetiliste helmestega. Genoomne DNA seondub spetsiifiliselt helmeste pinnal olevate funktsionaalsete rühmadega ja eraldatakse välise magnetvälja abil. Pärast mitut õrna pesemisetappi valkude, soolade ja muude lisandite eemaldamiseks elueeritakse lõpuks kõrge puhtusastmega genoomne DNA.

Spetsiaalselt keskkonnaveeproovide jaoks loodud komplekt ekstraheerib tõhusalt filtermembraanidele kogutud bakteriaalset DNA-d, sealhulgas gramnegatiivseid ja grampositiivseid baktereid (kuni 2 × 10⁹ bakterirakku ühe filtermembraani kohta). See ühildub täisautomaatsete nukleiinhapete ekstraheerimissüsteemidega suure läbilaskevõimega töötlemiseks. Ekstraheeritud DNA on ühtlase kvaliteediga ja seda saab otse kasutada PCR/qPCR, NGS ja muude allavoolu rakenduste jaoks.

Toote omadused

1. Laia spektriga bakterite ekstraheerimisvõime

Ekstraheerib veeproovidest tõhusalt nii gramnegatiivseid kui ka grampositiivseid baktereid, hõlmates magevee- ja merekeskkonnas tavaliselt esinevaid mikroobikooslusi ning vastates mitmekesistele analüütilistele nõuetele.

2. Kõrge puhtusaste ja kõrge saagikus

Annab kõrge puhtusastmega DNA-d, mis on vaba inhibeerivatest saasteainetest ja millel on stabiilsed saagised, mis sobivad otsesteks molekulaarseteks rakendusteks.

3. Automatiseeritud ja suure tõhususega ühilduvus

Täielikult ühilduv Bigfishi automatiseeritud nukleiinhapete ekstraheerimissüsteemidega, toetades 32 või 96 proovi samaaegset töötlemist, vähendades oluliselt töötlemisaega ja parandades labori efektiivsust.

4. Ohutu ja kasutajasõbralik kasutamine

Puudub vajadus mürgiste orgaaniliste reagentide, näiteks fenooli või kloroformi järele, mis minimeerib labori ohutusriske. Põhireagendid on eelnevalt pakendatud 96-süvendilistesse plaatidesse, vähendades käsitsi pipeteerimise vigu ja lihtsustades töövooge.

Ühilduvad instrumendid

Bigfish BFEX-16E

BFEX-32

BFEX-32E

BFEX-96E

Eksperimentaalsed tulemused

600 ml jõeveeproov filtreeriti läbi membraani ja DNA ekstraheeriti Bigfish magnethelmestel põhineva keskkonnavee genoomse DNA ekstraheerimise ja puhastamise komplekti abil koos ühilduva instrumendiga. Ekstraheeritud DNA-d analüüsiti seejärel agaroosgeelelektroforeesil.

M: Marker 1, 2: Jõevee proovid

Toote spetsifikatsioonid

Postituse aeg: 18. detsember 2025